长崎卫斯理公会大学（長崎ウエスレヤン大学），英文名称：Nagasaki Wesleyan University。是于1881年建立，2002年开设大学教育的日本私立大学。大学的简称为“卫斯理大”。

长崎外国语大学，英文名称：Nagasaki University of Foreign Studies，是于1945年建立，2001年开设大学教育的日本私立大学。大学的简称为“长崎外大”。

长崎综合科学大学，英文名称：Nagasaki Institute of Applied Science，是于1942建立，1965年开设大学部的日本私立大学。大学的简称为“长综大”。

长崎国际大学，英文名称：Nagasaki International University，是于2000年设立的日本私立大学。大学的简称为“国际大”“NIU”。学校采用小班制教育。

长崎纯心大学，英文名称：Nagasaki Junshin Catholk University。是于1935年建立，1994年设立大学部的日本私立大学。由学校法人纯心女子学园运营。

活水女子大学，英文名称：Kwassui Women's College，是于1879年建立，1981年开设大学部的日本私立大学。大学的简称为“活水”“活水女子大”。致力于为女性提供良好的教育环境。

九州看护福祉大学，英文名称：Kyushu University of Nursing and Social Welfare。是于1998年设立的日本私立大学。由学校法人雄本城北学园运营。

九州路德学院大学，英文名称：Kyushu Lutheran College，是于1997年开设的日本私立大学。大学的简称为“路大”“KLC”。该校是一所以心理学教育为主的学校。

熊本保健科学大学，英語: Kumamoto Health Science University，是于2003年设立的日本私立大学，由学校法人银杏学园运营。学校以保健看护专业见长。

尚絅学院大学，英文名称：SHOKEI GAKUIN UNIVERSITY，是于1892年创立，2003年开设大学教育的日本私立大学。前身是1892年由女性宣教师所开创的尚絅女学会。